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真核编辑质粒

pLV-U6-CasRxN-T2A-EGFP-IRES-Puro
发布时间:2020-12-30 12:32:14 | 浏览次数:


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CRISPR/Cas13 是CRISPR/Cas9 系列新发现的一种核酸酶编辑系统,与Cas9 靶向DNA 不同,Cas13可特异性靶向RNA,实现对细胞内RNA的定点编辑、剪切调控、敲低和清除等。现已发现等多个Cas13 核酸酶,都可以靶向切割RNA,其中CasRx(RfxCas13d)特异性和切割效率最高,也是现在发现最小的VI 型CRISPR系统效应蛋白。CasRx靶向切割RNA时,目标RNA的两端无需PFSFS序列(protospacer flanking sequence,PFS;相当于Cas9针对DNA的PAM序列),因此可以更灵活的的设计sgRNA,几乎可靶向RNA的任何位置。相较于CRISPRi以及shRNA等基因沉默技术,CRISPR/CasRx系统显示有更高的靶向敲低效率和特异性,以及更低的脱靶效应,是更有优势的基因敲低工具。CasRx与NLS(核定位信号) 融合表达时定位于细胞核,能更及时高效敲低mRNA以及在细胞核内其他RNA。

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参考文献

ranscriptome Engineering with RNA-Targeting Type VI-D CRISPR Effectors. Konermann S, Lotfy P, Brideau NJ, Oki J, Shokhirev MN, Hsu PD. Cell. 2018 Mar 8. pii: S0092-8674(18)30207-1. doi: 10.1016/j.cell.2018.02.033. 10.1016/j.cell.2018.02.033 PubMed 29551272

 
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